Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam71bQ5STT6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71bQ5STT6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71bQ5STT6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms