Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim58Q5NCC9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trim58Q5NCC9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim58Q5NCC9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms