Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttf2Q5NC05 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms