Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp22Q5DU02 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp22Q5DU02 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp22Q5DU02 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms