Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp13Q5BKP2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp13Q5BKP2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp13Q5BKP2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms