Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm14685Q52KH6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms