Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt35Q497I4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt35Q497I4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt35Q497I4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms