Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx25Q3ZT31 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx25Q3ZT31 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx25Q3ZT31 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx25Q3ZT31 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx25Q3ZT31 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx25Q3ZT31 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx25Q3ZT31 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx25Q3ZT31 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx25Q3ZT31 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms