Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim26Q3V460 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim26Q3V460 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms