Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1810049J17RikQ3V2G9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810049J17RikQ3V2G9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810049J17RikQ3V2G9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
1810049J17RikQ3V2G9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms