Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd5Q3V1H9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms