Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc185Q3V118 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc185Q3V118 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms