Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp48Q3V0C5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp48Q3V0C5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp48Q3V0C5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms