Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed1Q3V009 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmed1Q3V009 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms