Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trat1Q3UU67 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trat1Q3UU67 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trat1Q3UU67 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trat1Q3UU67 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms