Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B230104I21RikQ3USW4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B230104I21RikQ3USW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms