Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fchsd2Q3USJ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fchsd2Q3USJ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fchsd2Q3USJ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms