Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrc1Q3UPH1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc1Q3UPH1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrc1Q3UPH1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms