Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem253Q3UNB8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem253Q3UNB8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem253Q3UNB8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem253Q3UNB8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem253Q3UNB8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem253Q3UNB8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem253Q3UNB8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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