Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcgf5Q3UK78 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms