Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc61Q3UJV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.7 ms