Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zswim8Q3UHH1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zswim8Q3UHH1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zswim8Q3UHH1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms