Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mier3Q3UHF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mier3Q3UHF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mier3Q3UHF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mier3Q3UHF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mier3Q3UHF3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mier3Q3UHF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms