Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef3Q3UGY8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef3Q3UGY8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms