Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph3aQ3UFY4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rsph3aQ3UFY4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rsph3aQ3UFY4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms