Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft2Q3UF64 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft2Q3UF64 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft2Q3UF64 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft2Q3UF64 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft2Q3UF64 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft2Q3UF64 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft2Q3UF64 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft2Q3UF64 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnft2Q3UF64 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft2Q3UF64 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft2Q3UF64 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft2Q3UF64 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft2Q3UF64 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft2Q3UF64 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft2Q3UF64 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft2Q3UF64 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft2Q3UF64 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft2Q3UF64 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms