Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttll12Q3UDE2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttll12Q3UDE2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll12Q3UDE2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms