Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pid1Q3UBG2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pid1Q3UBG2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pid1Q3UBG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pid1Q3UBG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms