Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf180Q3U827 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf180Q3U827 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rnf180Q3U827 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf180Q3U827 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
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