Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U595 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U595 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U595 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U595 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U595 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U595 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U595 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U595 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U595 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U595 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U595 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U595 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U595 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U595 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3U595 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3U595 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3U595 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3U595 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3U595 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U595 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U595 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U595 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U595 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U595 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U595 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U595 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U595 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U595 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U595 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U595 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U595 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U595 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U595 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U595 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U595 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U595 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U595 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U595 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U595 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U595 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U595 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U595 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U595 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U595 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U595 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U595 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U595 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U595 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U595 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U595 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U595 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U595 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U595 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U595 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U595 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3U595 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3U595 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U595 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U595 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U595 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U595 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U595 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U595 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U595 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U595 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U595 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U595 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U595 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U595 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U595 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U595 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U595 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U595 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U595 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U595 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U595 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U595 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U595 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U595 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms