Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Vars2Q3U2A8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vars2Q3U2A8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vars2Q3U2A8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vars2Q3U2A8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms