Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serac1Q3U213 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Serac1Q3U213 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Serac1Q3U213 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms