Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem35bQ3U0Y2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem35bQ3U0Y2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem35bQ3U0Y2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms