Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc17a7Q3TXX4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc17a7Q3TXX4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a7Q3TXX4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms