Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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