Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3TTL0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TTL0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TTL0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTL0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTL0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTL0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3TTL0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTL0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTL0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTL0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTL0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTL0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTL0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TTL0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TTL0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTL0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTL0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTL0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTL0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTL0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTL0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTL0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTL0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTL0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTL0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTL0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTL0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTL0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTL0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTL0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTL0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTL0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTL0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTL0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms