Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Calr4Q3TQS0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Calr4Q3TQS0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Calr4Q3TQS0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Calr4Q3TQS0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms