Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDN2

Faf2, FAS-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf2Q3TDN2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Faf2Q3TDN2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf2Q3TDN2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Faf2Q3TDN2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Faf2Q3TDN2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms