Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC12,51□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12,5□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12,5□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12,5□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12,5□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,5□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12,5□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12,5□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,5□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,49□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12,48□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,48□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12,48□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12,48□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,48□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12,48□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12,48□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,47□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,47□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC12,47□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12,47□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC12,47□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,47□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,47□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC12,47□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC12,46□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,46□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12,46□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,46□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC12,45□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,45□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,45□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,45□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,45□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12,45□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,45□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12,45□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC12,45□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC12,44□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12,43□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,43□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,43□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC12,43□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,43□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,43□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12,43□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12,42□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12,41□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,41□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12,41□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,41□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12,41□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12,41□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12,41□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,41□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC12,41□□□□□ -0,42
Ush2AQ2QI47 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12,41□□□□□ -0,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,9 ms