Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Specc1lQ2KN98 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Specc1lQ2KN98 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms