Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Rpusd3Q14AI6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
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Rpusd3Q14AI6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rpusd3Q14AI6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rpusd3Q14AI6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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Rpusd3Q14AI6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Rpusd3Q14AI6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rpusd3Q14AI6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rpusd3Q14AI6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rpusd3Q14AI6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpusd3Q14AI6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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