Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Perm1Q149B8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Perm1Q149B8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Perm1Q149B8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Perm1Q149B8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms