Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne7Q0VE82 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne7Q0VE82 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpne7Q0VE82 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms