Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif3aQ0VBL6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms