Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spata18Q0P557 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Spata18Q0P557 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Spata18Q0P557 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spata18Q0P557 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spata18Q0P557 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms