Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kndc1Q0KK55 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kndc1Q0KK55 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kndc1Q0KK55 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms