Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgm3Q08189 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tgm3Q08189 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms