Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn1Q08091 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn1Q08091 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn1Q08091 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms