Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RelbQ04863 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RelbQ04863 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RelbQ04863 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RelbQ04863 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RelbQ04863 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RelbQ04863 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms