Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Emx2Q04744 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Emx2Q04744 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 363.3 ms